Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4DIPQ5VU43 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DIPQ5VU43 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms