Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HES3Q5TGS1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms