Protein–RNA interactions for Protein: Q5T890

ERCC6L2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6L2Q5T890 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ERCC6L2Q5T890 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ERCC6L2Q5T890 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
ERCC6L2Q5T890 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms