Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NHSL1Q5SYE7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms