Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms