Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNT1Q5JUK3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms