Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRDTQ58F21 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms