Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAN3Q58A45 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms