Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF394Q53GI3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF394Q53GI3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms