Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LONRF3Q496Y0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms