Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB8Q3ZCM7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB8Q3ZCM7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB8Q3ZCM7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB8Q3ZCM7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB8Q3ZCM7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms