Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms