Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIT3Q3SXY7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms