Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TWISTNBQ3B726 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms