Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HFEQ30201 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HFEQ30201 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HFEQ30201 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HFEQ30201 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HFEQ30201 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HFEQ30201 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HFEQ30201 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HFEQ30201 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HFEQ30201 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HFEQ30201 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HFEQ30201 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HFEQ30201 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HFEQ30201 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HFEQ30201 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HFEQ30201 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HFEQ30201 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HFEQ30201 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HFEQ30201 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HFEQ30201 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HFEQ30201 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HFEQ30201 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HFEQ30201 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HFEQ30201 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HFEQ30201 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HFEQ30201 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HFEQ30201 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HFEQ30201 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HFEQ30201 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HFEQ30201 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HFEQ30201 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HFEQ30201 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HFEQ30201 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HFEQ30201 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HFEQ30201 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HFEQ30201 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HFEQ30201 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HFEQ30201 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HFEQ30201 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HFEQ30201 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HFEQ30201 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HFEQ30201 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HFEQ30201 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HFEQ30201 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HFEQ30201 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HFEQ30201 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HFEQ30201 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HFEQ30201 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HFEQ30201 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HFEQ30201 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HFEQ30201 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HFEQ30201 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HFEQ30201 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HFEQ30201 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HFEQ30201 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HFEQ30201 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HFEQ30201 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HFEQ30201 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HFEQ30201 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HFEQ30201 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HFEQ30201 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HFEQ30201 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HFEQ30201 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HFEQ30201 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HFEQ30201 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HFEQ30201 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HFEQ30201 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HFEQ30201 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HFEQ30201 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HFEQ30201 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HFEQ30201 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HFEQ30201 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HFEQ30201 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HFEQ30201 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HFEQ30201 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HFEQ30201 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HFEQ30201 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HFEQ30201 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HFEQ30201 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HFEQ30201 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HFEQ30201 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HFEQ30201 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HFEQ30201 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HFEQ30201 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HFEQ30201 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HFEQ30201 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HFEQ30201 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HFEQ30201 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HFEQ30201 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HFEQ30201 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HFEQ30201 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HFEQ30201 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HFEQ30201 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HFEQ30201 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HFEQ30201 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HFEQ30201 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HFEQ30201 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HFEQ30201 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HFEQ30201 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HFEQ30201 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms