Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC27Q2M243 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms