Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKIDA1Q1XH10 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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