Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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NDUFA9Q16795 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFA9Q16795 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
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NDUFA9Q16795 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
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