Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTGISQ16647 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGISQ16647 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
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