Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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