Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKN1Q16512 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
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