Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMA4Q16363 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
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