Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1EQ15878 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms