Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USF2Q15853 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USF2Q15853 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USF2Q15853 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USF2Q15853 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USF2Q15853 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USF2Q15853 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USF2Q15853 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USF2Q15853 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USF2Q15853 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USF2Q15853 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
USF2Q15853 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USF2Q15853 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USF2Q15853 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USF2Q15853 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USF2Q15853 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USF2Q15853 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
USF2Q15853 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USF2Q15853 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USF2Q15853 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USF2Q15853 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USF2Q15853 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USF2Q15853 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USF2Q15853 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
USF2Q15853 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
USF2Q15853 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USF2Q15853 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USF2Q15853 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USF2Q15853 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USF2Q15853 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USF2Q15853 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USF2Q15853 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USF2Q15853 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USF2Q15853 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USF2Q15853 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USF2Q15853 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USF2Q15853 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USF2Q15853 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USF2Q15853 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USF2Q15853 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USF2Q15853 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USF2Q15853 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USF2Q15853 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USF2Q15853 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USF2Q15853 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USF2Q15853 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USF2Q15853 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USF2Q15853 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USF2Q15853 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USF2Q15853 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USF2Q15853 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USF2Q15853 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USF2Q15853 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USF2Q15853 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USF2Q15853 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USF2Q15853 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USF2Q15853 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USF2Q15853 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USF2Q15853 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USF2Q15853 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USF2Q15853 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USF2Q15853 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USF2Q15853 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USF2Q15853 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USF2Q15853 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USF2Q15853 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USF2Q15853 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USF2Q15853 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USF2Q15853 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USF2Q15853 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USF2Q15853 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USF2Q15853 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USF2Q15853 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USF2Q15853 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USF2Q15853 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USF2Q15853 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USF2Q15853 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USF2Q15853 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USF2Q15853 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USF2Q15853 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USF2Q15853 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USF2Q15853 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USF2Q15853 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USF2Q15853 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USF2Q15853 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USF2Q15853 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USF2Q15853 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USF2Q15853 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USF2Q15853 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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