Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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