Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85BQ15834 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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