Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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