Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
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SEC23AQ15436 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
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SEC23AQ15436 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
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SEC23AQ15436 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
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SEC23AQ15436 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
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SEC23AQ15436 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
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SEC23AQ15436 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
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SEC23AQ15436 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
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