Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOMM20Q15388 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOMM20Q15388 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms