Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
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UBE3CQ15386 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
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UBE3CQ15386 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
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UBE3CQ15386 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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UBE3CQ15386 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3CQ15386 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
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