Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEDD9Q14511 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
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