Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA4Q13772 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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