Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4BQ13620 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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