Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF4BQ13523 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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