Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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