Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CBX3Q13185 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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