Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA1Q13136 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA1Q13136 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
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