Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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