Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN3Q13033 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRN3Q13033 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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