Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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