Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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