Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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