Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TROAPQ12815 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms