Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXO1Q12778 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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