Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 ISR1YPR106W 1332 nt4.57□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 OPT2YPR194C 2634 nt4.57□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 YDL012CYDL012C 324 nt4.57□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 LHP1YDL051W 828 nt4.57□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 RAD27YKL113C 1149 nt4.57□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 YLL017WYLL017W 312 nt4.57□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 HCM1YCR065W 1695 nt4.57□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 PRD1YCL057W 2139 nt4.57□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 PDR15YDR406W 4590 nt4.56□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 YDR134CYDR134C 411 nt4.56□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 YGR015CYGR015C 987 nt4.56□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 NSG1YHR133C 876 nt4.56□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 WSS1YHR134W 810 nt4.56□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 DAN1YJR150C 897 nt4.56□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 MAP2YBL091C 1266 nt4.56□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 SFT2YBL102W 648 nt4.56□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 ATG14YBR128C 1035 nt4.56□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 TAF12YDR145W 1620 nt4.56□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 NGL3YML118W 1518 nt4.56□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 UGA2YBR006W 1494 nt4.56□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 SRS2YJL092W 3525 nt4.55□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 BGL2YGR282C 942 nt4.55□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 SNL1YIL016W 480 nt4.55□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 RPS1BYML063W 768 nt4.55□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 MDG1YNL173C 1101 nt4.55□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 PRP19YLL036C 1512 nt4.55□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 NUP133YKR082W 3474 nt4.55□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 YMR102CYMR102C 2505 nt4.54□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 MUP3YHL036W 1641 nt4.54□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 MNN10YDR245W 1182 nt4.54□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 FAU1YER183C 636 nt4.54□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 MMS2YGL087C 414 nt4.54□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt4.54□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 YGR182CYGR182C 354 nt4.54□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 GVP36YIL041W 981 nt4.54□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 MRT4YKL009W 711 nt4.54□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 YLR402WYLR402W 192 nt4.54□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 ATG8YBL078C 354 nt4.54□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 URE2YNL229C 1065 nt4.54□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 RCL1YOL010W 1104 nt4.54□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 NHP6AYPR052C 282 nt4.54□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 YBR134WYBR134W 402 nt4.54□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 ARX1YDR101C 1782 nt4.54□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 GPB1YOR371C 2694 nt4.54□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 BOI2YER114C 3123 nt4.54□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 PTR3YFR029W 2037 nt4.53□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 ECM22YLR228C 2445 nt4.53□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 YAE1YJR067C 426 nt4.53□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 YKL023WYKL023W 834 nt4.53□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 ARC40YBR234C 1155 nt4.53□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 ALG11YNL048W 1647 nt4.53□□□□□ -1.68
NFI1Q12216 IMD3YLR432W 1572 nt4.53□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 GDB1YPR184W 4611 nt4.52□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 CTF18YMR078C 2226 nt4.52□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 SRO7YPR032W 3102 nt4.52□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 PHO13YDL236W 939 nt4.52□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 YGR153WYGR153W 654 nt4.52□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 BIO2YGR286C 1128 nt4.52□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 VMA22YHR060W 546 nt4.52□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt4.52□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 PPA2YMR267W 933 nt4.52□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 GSP2YOR185C 663 nt4.52□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 BBP1YPL255W 1158 nt4.52□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 CMR3YPR013C 954 nt4.52□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 RSC30YHR056C 2652 nt4.52□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 IDS2YJL146W 1410 nt4.52□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 IOC4YMR044W 1428 nt4.52□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 ADP1YCR011C 3150 nt4.51□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 PHO87YCR037C 2772 nt4.51□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 DON1YDR273W 1098 nt4.51□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 BUR6YER159C 429 nt4.51□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 MLC1YGL106W 450 nt4.51□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 YIL152WYIL152W 708 nt4.51□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 GAT4YIR013C 366 nt4.51□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 ADD66YKL206C 804 nt4.51□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 UBI4YLL039C 1146 nt4.51□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 YMR130WYMR130W 909 nt4.51□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 YGP1YNL160W 1065 nt4.51□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 SER1YOR184W 1188 nt4.51□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 EUG1YDR518W 1554 nt4.51□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 NFI1YOR156C 2181 nt4.51□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 TRK1YJL129C 3708 nt4.51□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 CDC14YFR028C 1656 nt4.51□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 RSC3YDR303C 2658 nt4.5□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 YER077CYER077C 2067 nt4.5□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 SWP82YFL049W 1872 nt4.5□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 ALR2YFL050C 2577 nt4.5□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 MHR1YDR296W 681 nt4.5□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 MMS21YEL019C 804 nt4.5□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 RPN12YFR052W 825 nt4.5□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt4.5□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 YGR273CYGR273C 525 nt4.5□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 PSR1YLL010C 1284 nt4.5□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 UPS2YLR168C 693 nt4.5□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 snR37snR37 386 nt4.5□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 PUF2YPR042C 3228 nt4.5□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 ADY3YDL239C 2373 nt4.5□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 MIH1YMR036C 1665 nt4.5□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 RKM3YBR030W 1659 nt4.5□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 XKS1YGR194C 1803 nt4.49□□□□□ -1.69
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