Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCK1Q08629 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCK1Q08629 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCK1Q08629 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCK1Q08629 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCK1Q08629 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCK1Q08629 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCK1Q08629 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCK1Q08629 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCK1Q08629 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCK1Q08629 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCK1Q08629 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCK1Q08629 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCK1Q08629 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCK1Q08629 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SPOCK1Q08629 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPOCK1Q08629 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms