Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNK2Q07912 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms