Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CALD1Q05682 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms