Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD164Q04900 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD164Q04900 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD164Q04900 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD164Q04900 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD164Q04900 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD164Q04900 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD164Q04900 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CD164Q04900 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD164Q04900 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD164Q04900 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD164Q04900 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD164Q04900 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD164Q04900 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD164Q04900 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD164Q04900 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD164Q04900 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD164Q04900 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD164Q04900 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD164Q04900 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD164Q04900 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD164Q04900 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD164Q04900 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD164Q04900 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD164Q04900 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD164Q04900 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD164Q04900 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD164Q04900 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD164Q04900 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD164Q04900 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD164Q04900 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD164Q04900 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD164Q04900 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD164Q04900 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD164Q04900 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD164Q04900 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CD164Q04900 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD164Q04900 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD164Q04900 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CD164Q04900 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CD164Q04900 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CD164Q04900 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CD164Q04900 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CD164Q04900 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CD164Q04900 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CD164Q04900 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CD164Q04900 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CD164Q04900 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CD164Q04900 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CD164Q04900 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CD164Q04900 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CD164Q04900 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD164Q04900 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms