Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TAP1Q03518 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAP1Q03518 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms